Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT15P19012 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT15P19012 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT15P19012 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT15P19012 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT15P19012 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT15P19012 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT15P19012 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT15P19012 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT15P19012 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT15P19012 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms