Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYN1P17600 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYN1P17600 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYN1P17600 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYN1P17600 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYN1P17600 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYN1P17600 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms