Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPBP14678 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms