Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH1P12830 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDH1P12830 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDH1P12830 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDH1P12830 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH1P12830 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH1P12830 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms