Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC175P0C221 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC175P0C221 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms