Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NSD2O96028 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NSD2O96028 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSD2O96028 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSD2O96028 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSD2O96028 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSD2O96028 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms