Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTLL1O95922 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTLL1O95922 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms