Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F6O75461 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2F6O75461 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F6O75461 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms