Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC9O60706 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ABCC9O60706 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
ABCC9O60706 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ABCC9O60706 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms