Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT7O43581 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT7O43581 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT7O43581 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT7O43581 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYT7O43581 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT7O43581 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYT7O43581 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYT7O43581 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms