Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COCHO43405 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COCHO43405 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COCHO43405 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COCHO43405 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COCHO43405 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COCHO43405 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COCHO43405 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COCHO43405 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COCHO43405 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COCHO43405 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COCHO43405 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms