Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms