Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms