Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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