Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA8SH3BPF8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms