Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NCOA3Q9Y6Q9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms