Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms