Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP12Q9Y561 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms