Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RAD54L2Q9Y4B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RAD54L2Q9Y4B4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms