Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP20Q9Y2K6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP20Q9Y2K6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms