Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPS5Q9UPZ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HPS5Q9UPZ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms