Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SETD1BQ9UPS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SETD1BQ9UPS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms