Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG5Q9UPR3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG5Q9UPR3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms