Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RIMS3Q9UJD0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms