Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CKLFQ9UBR5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKLFQ9UBR5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms