Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPARGC1AQ9UBK2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPARGC1AQ9UBK2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms