Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPG2Q9UBF2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms