Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFIP11Q9UBB9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFIP11Q9UBB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms