Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXXC1Q9P0U4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXXC1Q9P0U4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms