Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCMF1Q9P0J7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCMF1Q9P0J7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms