Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT57Q9NWB7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT57Q9NWB7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms