Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJB4Q9NTQ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms