Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 NELFE-212ENST00000492539 583 ntTSL 331.48■■■□□ 2.632e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-206ENST00000542306 1246 ntTSL 531.11■■■□□ 2.572e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.442e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.432e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 230.01■■■□□ 2.392e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.098e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.962e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.952e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.892e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 425.76■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-207ENST00000454913 914 ntTSL 525.56■■□□□ 1.682e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-206ENST00000507833 552 ntTSL 424.92■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-213ENST00000541953 570 ntTSL 524.67■■□□□ 1.542e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)24.53■■□□□ 1.529e-14■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-204ENST00000436289 906 ntTSL 524.39■■□□□ 1.492e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.132e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-212ENST00000514740 532 ntTSL 421.64■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-203ENST00000537804 261 ntTSL 521.64■■□□□ 1.062e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-202ENST00000422370 5943 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.962e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-205ENST00000535452 533 ntTSL 420.5■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-203ENST00000426722 765 ntTSL 520.26■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 320.21■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 519.58■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.699e-14■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.689e-14■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 519.17■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-211ENST00000541667 671 ntTSL 418.44■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-210ENST00000511925 529 ntTSL 417.66■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-205ENST00000441998 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.15■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-205ENST00000504089 567 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.55■□□□□ 0.249e-14■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-213ENST00000494956 568 ntTSL 316.38■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-203ENST00000534830 547 ntTSL 416.06■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 NELFE-214ENST00000625905 111 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 GPSM2-206ENST00000446797 571 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.769e-14■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.192e-7■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.22e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.982e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-205ENST00000460484 1227 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.172e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.272e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 SEC61G-206ENST00000461536 437 ntTSL 26.58□□□□□ -1.362e-20■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 328.29■■■□□ 2.121e-9■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 325.61■■□□□ 1.691e-9■■■■□ 20.6
DROSHAQ9NRR4 LTB4R2-203ENST00000530080 1108 ntTSL 1 (best)43.84■■■■■ 4.615e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.55e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)39.51■■■■□ 3.921e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 LTB4R2-201ENST00000527924 710 ntTSL 337.4■■■■□ 3.585e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.325e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 535.31■■■■□ 3.245e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 333.08■■■□□ 2.898e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.781e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 231.48■■■□□ 2.635e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)31.31■■■□□ 2.65e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-202ENST00000343290 583 ntTSL 330.27■■■□□ 2.445e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.425e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 229.66■■■□□ 2.345e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 229.61■■■□□ 2.335e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.211e-8■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.835e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 225.87■■□□□ 1.735e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 424.84■■□□□ 1.575e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.05■■□□□ 1.445e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 424.04■■□□□ 1.448e-9■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 522.08■■□□□ 1.135e-15■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 219.11■□□□□ 0.655e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.615e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-209ENST00000435716 603 ntTSL 312.8□□□□□ -0.365e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.095e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.245e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 522.88■■□□□ 1.256e-10■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 420.71■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.26e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 526.54■■□□□ 1.841e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)24.01■■□□□ 1.431e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 528.16■■■□□ 2.17e-7■■■■□ 20.5
DROSHAQ9NRR4 PRSS21-205ENST00000571141 484 ntTSL 229.95■■■□□ 2.394e-9■■■■□ 20.5
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