Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAPOLBQ9NRJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms