Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR55Q9H6Y2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
WDR55Q9H6Y2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms