Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRNP2Q9H175 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP2Q9H175 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms