Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM49AQ9H0Q0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM49AQ9H0Q0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms