Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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FOXQ1Q9C009 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXQ1Q9C009 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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