Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NLRP1Q9C000 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms