Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FANCD2Q9BXW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FANCD2Q9BXW9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms