Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB2BQ9BVA1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms