Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CHCHD7Q9BUK0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CHCHD7Q9BUK0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CHCHD7Q9BUK0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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