Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMSS1Q9BQ75 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMSS1Q9BQ75 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms