Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms