Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RDH12Q96NR8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RDH12Q96NR8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms