Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC138Q96M89 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms