Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC7Q96M83 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC7Q96M83 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC7Q96M83 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms