Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71F1Q96KD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms