Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPNQ96H22 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPNQ96H22 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms