Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC35A4Q96G79 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC35A4Q96G79 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms